HaberlerTeknoloji & Bilim

Açık denizlerde yeni türler arayışı

4 Mins read
Açık Denizlerde Yeni Tür Arayışı

Tek hücreli Holozoa ağı. Çevresel sekanslar üçgenler ve referans sekansları daire şeklinde tasvir edilmiştir. Çizgiler benzer dizileri birleştirir. Yeni Holozoa grubu MASHOL’a ait diziler kırmızı üçgenler olarak gösterilmiş ve siyah daire içinde vurgulanmıştır. Kredi: Arroyo ve diğerleri (2020)

Gezegendeki çok sayıda yaşam formunun% 25’inden daha azının, belki de% 0,01’den daha azının karakterize edildiği tahmin ediliyor. Bu liste arasında, mikroskobik organizmalar özellikle zayıf bir şekilde temsil edilmektedir: Tüm ökaryotların% 80’e kadarı protist iken (yani, tek hücreli ökaryotlar), bunlar açıklanan ökaryotik türlerin yalnızca% 3’ünü oluşturur.

Bilinen ve olmayan arasındaki bu çarpıcı boşluk, taksonomik grupların ve özelliklerin evriminin anlaşılmasını büyük ölçüde sınırlıyor. Bir makalede Genom Biyolojisi ve Evrim İspanya’daki Institut de Biologia Evolutiva ve Fransa’daki Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité’deki araştırmacılar, “Gen benzerlik ağları, Tara Oceans keşif gezisindeki hayvanlarla yakından ilgili potansiyel yeni bir tek hücreli grubu ortaya çıkarıyor” başlıklı dünyanın okyanusları ve yeni soyların keşfinin, cevaplanmamış evrimsel soruları ele almaya nasıl yardımcı olabileceğini ortaya koyuyor.

Tek hücreli atalarımızdan çok hücreli hayvanlara yol açan evrimsel süreçleri anlamaya odaklandı. Bunun için araştırmacılar, Holozoa olarak bilinen ve Choanoflagellatea, Filasterea ve Teretosporea’yı (Ichthyosporea ve Corallochytrea) içeren bir grup protist olan en yakın yaşayan hayvan akrabalarına baktılar. Önceki örneklemler, bu sınıfın birçok üyesinin karakterize edilmemiş olduğunu ve çok hücreliliğin kökenine dair anlayışımızı sınırlayan eksik bir resim sağladığını ileri sürdü. Institut de Biologia Evolutiva’da bir ICREA araştırma profesörü olan Iñaki Ruiz-Trillo ve meslektaşları, hayvanlarla yakından ilgili protistlerin gerçek çeşitliliğini daha iyi anlayarak bunu düzeltmeye çalıştılar.

Çevresel metagenomik, çevreden -belki bir gölden su veya bir ormandaki toprak- numunelerin alınmasını ve mümkün olduğunca çok sayıda farklı organizmadan sekanslar yakalamayı içerir. Elde edilen verilerin analizi, dizileri bir arada gruplandırmak ve onları türetdikleri organizmalara geri bağlamak için karmaşık yöntemler gerektirse de, bu yaklaşım daha önce karakterize edilmemiş bir organizmayı tanımlamak için başarıyla kullanılmıştır. Ruiz-Trillo’ya göre, “küçük bir su örneğinden milyonlarca DNA dizisini analiz etme ve bu ekosistemde ne tür türlerin yaşadığını bilme, çok güçlü bir tekniktir.”

Yazarlar, çalışmalarında dünyanın 210 noktasından alınan 1.000’den fazla okyanus suyu örneğinden verileri analiz ettiler. Örnekler gemide toplandı TaraPlanktonik çeşitliliği örneklemek ve karakterize etmek için 4 yıllık bir keşif gezisinin parçası olarak dünyayı kateden bir proje. Her türün genomunun sadece küçük bir kısmı sıralandığı için, Ruiz-Trillo ve ark. verileri analiz etmek için gen benzerlik ağlarını kullandı. Bu teknik genellikle ekolojik etkileşimleri incelemek için kullanılır ve nadiren metagenomik verilere uygulanmıştır. Her benzersiz dizinin bir nokta olarak temsil edildiği ve benzer dizilere bir çizgi ile bağlandığı ağların çizilmesini içerir. Her bir noktanın ne kadar bağlantılı olduğu ve hangi noktaların merkezde ve ağın çevresinde olduğu gibi ağ özellikleri, dizilerin kimliği ve biyolojik çeşitliliği hakkında bilgi sağlar.

Bu yaklaşımı kullanarak araştırmacılar, okyanus örneklerinden gelen dizileri Holozoa üyelerinden geldiği bilinen referans dizilerle karşılaştırdılar. Elde ettikleri sonuçlar, dünya okyanuslarında bilinmeyen / karakterize edilmemiş tek hücreli Holozoanları temsil etmesi muhtemel 2.000’den fazla benzersiz diziyi ortaya çıkardı. Özellikle, hayvanların en yakın yaşayan akrabaları olarak kabul edilen, koanoflagellatlarla yakından ilişkili bir grup organizma belirlediler. Bu ilişki nedeniyle, yazarlar tarafından MASHOL (Marine Small HOLozoa) olarak adlandırılan bu yeni keşfedilen grubun gelecekteki analizleri, çok hücreliliğin evrimine ve hayvanların kökenine yeni bir bakış açısı sağlayabilir.

Bu yeni sınıfın keşfine ek olarak, çalışma, Kuzey Kutbu, Güney Pasifik, Kuzey Pasifik veya Atlantik Okyanuslarında daha bol bulunan alt grupların yanı sıra tercih edenleri belirleyerek çeşitli Holozoanların coğrafi dağılımının ilk analizini sağlar. daha derin veya daha sığ su. Son olarak, yazarlar önceden bilinmeyen türler arası ilişkileri belirlemek için belirli hayvan dizileriyle birlikte meydana gelen Holozoan dizilerini aradılar. Bu analiz, Holozoanların hayvan parazitleri veya ortakyaşları olabileceği hakkında yeni hipotezler sağlar.

Yazarlar, yalnızca dizi verilerine dayanan bir çalışmanın sınırlı bir perspektif sağladığını kabul ederken, çalışmalarının farklı soylar arasındaki ilişkilerin daha iyi anlaşılmasına katkıda bulunduğunu ve yeni mikrobiyal türleri tanımlayan gelecekteki çalışmaların önünü açabilir. “Analizlerimiz, yeni türler veya soylar aramaya nereden başlayacağınıza dair bir ipucu sağlıyor. Hayat ağacı çok büyük ve yeni mikrobiyal türler keşfetmek zor, zaman alıcı bir iş. Çalışmamız, bu organizmaların bulunabileceği habitatları öneriyor, filogenetik ilişkilerine dayalı olarak hangi özelliklere sahip olabileceklerinin yanı sıra, bu çabadaki gelecekteki girişimler için ipuçları sağlar. ”


Choanozoan ve picozoan deniz protistleri muhtemelen virüs yiyiciler:


Daha fazla bilgi:
Arroyo A, vd. 2020. Gen benzerliği ağları, Tara Oceans keşif gezisindeki hayvanlarla yakından ilgili potansiyel yeni bir tek hücreli grubu ortaya çıkarıyor. Genom Biol Evol. 12 (9): 1664–1678. doi.org/10.1093/gbe/evaa117

Casey McGrath vd. Vurgu: Açık Denizlerde Yeni Tür Arayışı, Genom Biyolojisi ve Evrim (2020). DOI: 10.1093 / gbe / evaa156

Alıntı: Açık denizlerde yeni tür arayışı (2020, 6 Ekim) 6 Ekim 2020 tarihinde https://phys.org/news/2020-10-species-high-seas.html adresinden erişildi.

Bu belge telif haklarına tabidir. Özel çalışma veya araştırma amacına yönelik herhangi bir adil işlem dışında, yazılı izin olmadan hiçbir bölümü çoğaltılamaz. İçerik yalnızca bilgi amaçlı sağlanmıştır.

Benzer Haberler
Haberler

CHP'nin 2021 asgari ücreti: 3 bin 100 lira

1 Mins read
Milyonlarca işçinin merakla beklediği 2021 yılı asgari ücret miktarı, Aile ve Çalışma Bakanı Zehra Zümrüt Selçuk tarafından açıklandı. Buna göre asgari…
Haberler

‘Genelge beni bağlamaz’ dedi 24 kez ceza yedi

1 Mins read
Zonguldak’ta tantunici Erkan Cinbir, iş yerine müşteri alınca polisle tartıştı. Dükkanına gelen polislere “Genelge beni bağlamaz” diyen Cinbir, “corona virüsü yok” diye…
HaberlerTeknoloji & Bilim

Gökbilimciler 591 yüksek hızlı yıldız keşfetti

1 Mins read
2005 yılında ilk yüksek hızlı yıldız keşfedildikten sonra, 15 yıl içinde 550’den fazla yıldız birden çok teleskopla keşfedildi. Çin Bilimler Akademisi Ulusal…
Power your team with InHype

Add some text to explain benefits of subscripton on your services.

Bir cevap yazın

E-posta hesabınız yayımlanmayacak. Gerekli alanlar * ile işaretlenmişlerdir